AlphaFold「奠基人」周耀旗:用37年的边角料研究,找一座「精神乌托邦」

每次看到家中昙花盛开 , 周耀旗会想到自己的科研生活:长时间寂静 , 一霎那绽放 。 这些年里 , 他找到了一种打理自己的方式 , 就是把自己的经验教训写进博客 。 他乐于将个人的故事与公众分享 , 如同他总会接纳外界的声音 。
当全世界都沉浸在进入新世纪的喜悦时 , 37岁的周耀旗在家中挑灯夜战 , 他憋了一口气 , 要写出一份最好的申请书 , 拿到他独立研究时的第一笔经费 。
从2000年开始 , 每年的申请季 , 周耀旗就会陷入时刻琢磨申请书的状态 。 但直到第三年 , 他才拿到首笔经费 。
周耀旗的女儿曾在日记中写道 , “有几次 , 爸爸刚放下怀里的电脑 , 才夹了一筷子菜 , 突然想起什么 , 冲向沙发 , 抓起电脑 , 乒乒乓乓一阵敲打 。 ”
那是周耀旗的第一份教职 , 学校坐落在纽约州第二大城市布法罗 。
彼时 , 那位刚从哈佛大学离开的博士后 , 师从诺贝尔奖获得者MartinKarplus、直博就读于杨振宁所执教的纽约州立大学石溪分校、八十年代中美化学研究生项目中的两百余人之一 , 在20世纪刚刚结束时 , 结束了他16年的求学岁月 。
在外界看来 , 那些经历本应是周耀旗最大的荣耀与敲门砖 , 但从他做独立研究的那一刻 , 所有的光环仿佛消失了 。
他困顿、焦虑、沮丧、又重振旗鼓 , 用新成果对抗失败 。
在那些漫长的探索中 , 有一条周耀旗始终坚持着的科研主线——蛋白质结构里的二面角的预测 。 他自嘲 , 做的是科研中的“边角料”工作 , 却将那些不起眼的工作做到极致 。
正是有那些积累 , 让他第一个把深度学习方法应用到蛋白质主链结构预测中 。 早在谷歌大热的AlphaFold出现之前 , 就与团队发展了神经网络回归预测蛋白质真实二面角 , 推断出蛋白质结构的预测方法 , 是端对端的蛋白质结构预测在神经网络外的实现 。
AlphaFold「奠基人」周耀旗:用37年的边角料研究,找一座「精神乌托邦」
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在科研的另一面 , 周耀旗的经历同样吸引人 。
他离家张家港 , 学至中科大 , 东征纽约直博 , 西至加州创业 , 辗转重回纽约 , 博士后南下北卡 , 又北上哈佛 , 在布法罗、印地安纳、澳洲 , 度过了二十年的教学岁月 。
从周耀旗身上 , 我们能看到一个科研人如何延续学科中的最小分支 , 也能看到一个人的三十年 , 是如何创业折返、三换导师、四次跳槽 , 以及无数次经费被拒的经历 。
如今 , 在与祖国阔别了36年后 , 周耀旗来到代表中国40年发展奇迹的城市 , 在深圳湾实验室里 , 开始新的故事 。
一次被“抓壮丁”的出国机会“没主见、不主动、不爱说话 , 只有学习好一点 。 ”这是周耀旗的父亲给他的评价 。
1963年 , 周恩来在上海科学技术工作会议上 , 强调实现科学技术现代化时 , 周耀旗出生了 。
六十年代 , 周耀旗的家乡张家港依港而兴 , 成为那个年代最早对外开放的窗口 。 那时的周耀旗不会想到 , 自己将从这个小港口出发 , 在大洋彼岸开始36年的异国生活 。
周耀旗在国内读书时有两个重要经历 , 一次是提前冲刺高考 , 一次是意外获得出国机会 。
1979年 , 读高二的周耀旗作为毕业生参加高考 , 尽管高一时冲击未果 , 但这一次 , 他顺利考进了中国科学技术大学 , 并以化学高分的成绩录取到近代化学系 。
至于为何学起了化学 , 周耀旗说道 , 79年的高考化学特别难 , 自己倒是发挥不错 , 也就因为这个优势 , 填了中科大的近代化学系 。
后来 , 周耀旗才知道 , 那一年 , 全国有468万学生走进考场 , 录取约28万 , 录取率不足6% , 而他就是当中幸运的一份子 。