AlphaFold「奠基人」周耀旗：用37年的边角料研究，找一座「精神乌托邦」( 四 ) 每次看到家中昙花盛开

在博士的最后三年里，周耀旗一共在凝聚态理论方面发表了22篇论文。其中19篇是第一作者，还有多篇成为了液体统计理论上的开创性工作。
毕业前，周耀旗写下一首打油诗，他以此记录自己那五年中的混沌与觉醒。
“乘风驾云把西征，面壁五年为求真。悬梁刺股秋风寒，冬天过了终于春。 ”

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周耀旗（右一）与两个导师以及表情各异的同学们合影
1990年3月，长岛的寒冰刚刚破碴，周耀旗的科研生涯告一段落，第一次站在了人生的十字路口。
原来从来没有想过留下来的他，由于当时国内外的社会气氛，回国的念头被打消，但也不知道找工作怎么找，从哪里开始。
这时，校友张永峰打来了电话。他曾在中科大做过老师，通过杨振宁特别项目在石溪读了计算化学博士，毕业后去了加州理工做了诺贝尔奖获得者RudolphA.Marcus的博士后。
他邀请周耀旗加入应用物理化学实验室（AppliedPhysandChemLab ， APCL），去从事量子化学方面的科研。
去了之后周耀旗才知道，这是一家3个人的初创公司，好在刚开始日常工作与周耀旗的博士研究相差不大，随遇而安的他每天兢兢业业，动脑卖力，很快发表了一篇量子化学方面的论文。
但不久，公司发现搞科研没有“钱”途，转型成为营利公司，专做环境保护测试。周耀旗也跟着换了岗位，做起了实验室信息系统管理、市场、推销、客户服务、业务管理，不久成了全面负责的实验室主任。

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周耀旗（右一）与加州应用物理化学实验室（APCL）同事合影，张永峰（左一）
这是他的第一份工作，但三年过去，创业新鲜感消失了，日常工作也变得重复琐碎。虽然那时公司事业变得蒸蒸日上，团队从几个人到了二十多个，但周耀旗却开始自我质疑， “人活着难道就是为了挣钱？这是做事业的感觉吗?如果钱赚得多一点，做管理就算有出息的话，这样的出息有什么劲？”
他特别怀念一门心思做科研的日子，那种生活虽然也非常辛苦，但自己享受那个过程。
“如果能做自己喜欢的科研，还能有口饭吃，岂不是更好？”
三十岁那年，周耀旗下定决心：回去做学问，赌一赌自己有没有做教授的命。
周耀旗选了一个“崭新”的日子：1994年1月1日，他辞掉了自己的第一份工作，回到石溪，在两个博士导师那做起了博士后。
在周耀旗看来，这不是走回头路，而是重新获得了一段沉浸自己的时间。多年后，周耀旗这样描述这段时光， “我是三十才立志，才知道自己该追求什么。 ”
他在博客中一字一句写下， “三十岁以前，我一直是随波逐流，没有自己的主见，别人替我做选择。之后的日子，我要自己做决定，就算衣带渐宽，几经波折，从此浪迹天涯，也无怨无悔。 ”
三换博士后导师、连投三年简历事实证明，周耀旗赌对了，但过程也极其曲折：他曾三换博士后导师，博士后第二年才拜入哈佛大学MartinKarplus教授门下。兜兜转转中，他也找到了倾其一生的事业——计算生物学。
1994年初，周耀旗回到Friedman和Stell那里。只做了两个月，突然两个导师被告知， “科研经费马上要用完了，你要另找其他学校的博士后了。 ”
周耀旗马上行动，在同事和导师的帮助下，海投了几十份申请信。当时周耀旗觉得，只要跟理论计算相关的教授，不管有没有发出招聘广告，或许都是一线生机。