三一教圣地——东山祖祠位于莆田城内东岩山南麓 ， 与城外“石室岩”东西相对 。宋时即名曰东岩山 ， 简称东山；因山上岩石呈乌色 ， 古时称乌石山；又因麒麟献瑞 ， 福建省按院垄一清题字刻石名麒麟山 ， 是城内一座最高山 。拂晓登上巅峰而观东海 ， 高瞻远瞩 ， 兴化湾外岛屿罗列旭日东升 ， 气势磅礴 ， 沧海无波 ， 无际远流 ， 景色蔚为大观 ， 名为“东山晓旭” ， 列为莆田二十四景之首 。
东山祖祠占地面积6.9亩 ， 重檐宫殿式 ， 三进五厅座北朝南 ， 依中轴线有山门、石埕、拜亭、丹墀 ， 祖祠大殿（宗孔堂） 。古色古香的明代建筑群、朴实大方 ， 物华地灵 ， 大殿东边新建的林龙江纪念馆宏伟壮观 ， 与自然景观融为一体 ， 晓旭风光在这里凸现 。
祖祠原系林龙江先生的祖父林富建造的别墅“东山樵舍” ， 明代为“麟峰书院” ， 林龙江先生曾在此讲学 。至明穆宗隆庆五年(1571年)又建三亭四轩 ， 次年匾其堂名曰三教宗孔堂 。林龙江先生逝世四年后 ， 门人陈道章等将三教宗孔堂建成为林龙江先生祠堂 ， 改为“麟山祖祠”俗称“东山祖祠” ， 主祀三一教主林龙江先生 ， 清宣统元年(1909年)改建匾称“东山祖祠” ， 沿用至今 ， 建筑物保持明清风格 。
祖祠山门系马来西亚、吉隆坡三教堂全体门人和祖祠门人于1997年捐资修建 。山门石刻楹联“天地无私咸化育；圣贤立说序纲常”、“道炳乾坤扶万古；学参天地贯三门”和东山祖祠匾额引人入胜 。外廊两侧各奉天神地祗守门将军 。
进入山门的大埕 ， 周围花木盆景宜人 。大埕两边是靠壁廊 ， 大埕台阶两边立着两只吉祥如意的石狮 ， 右侧有一涌泉井 ， 清泉从石缝里涌出 ， 源源不断 ， 大旱之年不枯竭 ， 井水清辙可口属天然矿泉水 。
走进拜亭 ， 身临其境 ， 领略祠内风韵 ， 顿觉开朗 。拜亭长达20米 ， 宽10米 ， 整数个拜亭由24支石柱支架构建而成 ， 每支石柱刻有对联：“夏门普及亚欧美；圣道贯通天地人 。”“道从太极归无极 ， 学赖先生启后生”等等字迹遒劲有力 ， 意义深远 ， 传播海内外 。正中设有虚空桌和麒麟桌龛；东西两边摆设背椅 ， 供门人游客瞻仰和休息；逢年过节 ， 十音和八乐在此演奏庆祝升平 。
拜亭石埕东、西两向各有一宝鼎 ， 三层高4.2米 ， 由马来西亚门人和祖祠门人捐赠 ， 丹墀上两石雕麒麟腾空驾雾 ， 呈祥献瑞 ， 正中有新加坡天性祠门人于1997年捐赠的铜炉 ， 刻有“正气浩然”四个大字 。
过丹墀是祖祠大殿 ， 正中匾“宗孔堂”三个大字 ， 1988年重修 ， 五厢式 ， 宽敞高大；宗孔堂内正中奉祀三一教主林龙江金身神像 ， 上额“倡明三氏” ， 是1988年夏教中华台湾总会捐赠；教主神像左边奉祀张三丰仙师金身神像；右边奉祀卓晚春真人金身神像；正堂东西两向列祀：“四配金身坐像” ， 即教主四大门徒；卢文辉先生、林贞明先生、朱逢时先生、张洪都先生 。各尊塑像形态逼真 ， 栩栩如生 。惟妙惟肖 ， 令人肃然起敬 。各地教徒成群结队临祠朝拜敬佛 ， 香火鼎盛 ， 游客络绎不绝 。大殿前东边伽蓝奉祀关圣帝君 ， 旁有绍贤堂；西边护法奉祀黄师爷 ， 旁有立德堂 。
相传东山乌石现麒麟 ， 有形似麒麟的乌石团呈现在大殿前石埕东侧 ， 故名曰麒麟石 。大殿后有棵千年古樟 ， 树围达13.8米 ， 据载植于晋代 ， 至今有1700年树龄 。一株三桠长势 ， 一支树叶繁茂 ， 两支虽枯近年出现再生奇迹 ， 相传为三教合一的象征 ， 道统相传之意义 ， 为“八闽第一樟” ， 是省文物保护之树 。
大殿东侧新建的林龙江纪念馆 ， 于1991年由海内外信众捐建 ， 三层楼宇翅梁画栋慰为壮观 。馆内陈列林龙江先生经典著作和生平事迹 。纪念馆的山门用花岗岩石砌建 ， 仿古建筑 ， 与旭日相辉映 。山门两边墙壁镶嵌海内外名人题祠 ， 弘扬林龙江经典文化 ， 学习林龙江爱国精神 。
东山祖祠是三一教发祥地 ， 是三一教信徒、信众及社会善男信女学道、传道、朝圣的圣地 ， 至今有近500年历史 ， 是三一教教务活动中心 ， 现为莆田市三一教协会会址 。现在 ， 她将继续成为联系海内外炎黄子孙寻根祭祖、增进联谊、学术交流、传播林龙江文化的纽带和摇篮 。