国产AI蛋白质结构预测再现突破,用单条序列解决3D结构( 二 )


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而华深智药表示:
OmegaFold的出现补全了蛋白质三维结构预测的最后一块拼图 。
另外 , 华深智药还披露了OmegaFold背后的技术细节 。
具体来看 , OmegaFold能够用单一序列取代多重同源序列 , 是因为研究团队采用了一种 , 基于几何信息的深度学习模型——OmegaPLM 。
该学习模型可以根据蛋白质的序列信息 , 预测原子坐标 , 同时经过训练学习 , 预测原子在三维空间的距离 。
在不断的迭代之后 , 可以让这些预测出来的原子坐标和距离 , 满足基本的几何定律 , 最终形成蛋白质结构 。
国产AI蛋白质结构预测再现突破,用单条序列解决3D结构
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OmegaFold的能力 , 和背后的技术原理整明白了 , 最后还剩下一个问题:
华深智药是谁?公开信息显示 , 华深智药是一家AI创新药物研发商 , 成立于2021年6月 , 总部位于北京 , 最早是由张亚勤旗下的清华大学智能产业研究院孵化而来 。
早在去年12月份 , 华深智药开发的HeliXonAI算法 , 就在全球持续蛋白质结构预测竞赛CAMEO上 , 实现对AlphaFold2的反超 , 以84.0的lDDT预测精确度得分 , 刷新了CAMEO竞赛得分记录 。
国产AI蛋白质结构预测再现突破,用单条序列解决3D结构
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一家成立半年左右的初创企业 , 出道即巅峰 。
而巅峰背后的关键先生 , 就是华深智药创始人彭健 。
彭健 , 伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校(UIUC)计算机科学系及医学院终身教授 , 计算生物领域的知名大牛 , 机器学习与蛋白质结构和功能预测的顶级科学家 。
国产AI蛋白质结构预测再现突破,用单条序列解决3D结构
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他在博士期间设计的著名算法RaptorX , 以及在UIUC任教期间设计的DeepContact算法 , 多次在CASP比赛中获得领先的成绩 , 并很早就尝试将深度学习的技术引入这个领域 。
彭健也因此在2016年获得有“诺奖风向标”之称的斯隆研究奖 , 并于2020年获得计算生物领域最高奖奥弗顿奖(OvertonPrize) , 成为该奖项20年来首位华人得主 。
去年6月 , 彭健看到AI在生物制药领域的应用前景 , 于是就在清华大学智能产业研究院孵化之下 , 正式创办华深智药 。 很快便完成了千万美元级天使轮融资 。
同时在今年6月 , 成立一周年之际 , 华深智药又完成由五源资本领投 , 高榕资本、NeumannCapital以及三家天使轮投资方襄禾资本、高瓴创投、清智资本跟投的A轮融资 , 融资金额近5亿元人民币 。
参考链接:
[1]https://helixon.s3.amazonaws.com/omegafold.pdf
[2]https://twitter.com/peng_illinois/status/1538536909814874113—完—
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