成为造物主:如何利用合成生物学的神力( 二 )
使能技术:使能技术(EnablingTechnology)并无严格定义 , 其内涵受技术创新的目标决定 。 从技术创新链的角度 , 使能技术处于基础研究和产品研发之间 , 属于应用研究的范畴 , 其使命是通过使能技术的创新 , 来推动创新链下游的产品开发、产业化等环节的实现 。
首先是基因测序技术 。 如今的第二代基因测序法经过持续优化 , 效率已经大幅上升且成本快速降低(第三代技术不成熟 , 尚无法大规模应用) 。 McKinsey给出数据显示 , DNA测序成本正在以比摩尔定律更快速度下降:2003年 , 绘制人类基因图谱耗资近30亿美元;到了2019年 , 这一数字已经不足1000美元 , 且在未来十年甚至更短时间内有望进一步下降至100美元区间内[5] 。
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基因组编辑技术 , 是指对目标基因进行编辑或修饰 , 能够定向修改基因组的重要工具 。 由于合成生物学对于DNA等遗传物质的合成、组装和编辑等操作均有关键需求 , 因此强大的基因编辑技术也是合成生物行业整体发展的重要前提 。
基因编辑技术分为三代 , 分别为ZFN、TALEN和CRISPR/Cas9 。 前两代技术采用的是蛋白质—DNA的识别模式 , 导致切割位点有较高的特异性 , 无法随心所欲的选择切割位点 , 且分别存在构建难度大和易于脱靶 , 或是操作繁琐的缺陷 。
CRISPR/Cas9:CRISPR全称为规律成簇的间隔短回文重复(ClusteredRegularlyInterspacedShortPalindromicRepeats) , 是原核生物基因组内的一段重复序列 , 大多数细菌及古细菌中的一种获得性免疫方式 。 Cas9则指的是一种CRISPR相关蛋白(即Cas) , 充当“分子剪刀” , 在引导RNA指定的位置切割DNA 。 2020年的诺贝尔化学奖正是颁给了贡献这一发现的科学家 。
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相较于前辈 , CRISPR/Cas9采用的是RNA-DNA的识别模式 , 切割位点的选择上更为广泛 , 且操作简便 , 周期短 , 成本低 , 调控方式多样化 。 凭借这些优势 , CRISPR/Cas9已经成为应用最为广泛的基因组编辑工具 。
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大规模基因组DNA设计和合成的相关技术 , 是改造细胞或创造人工生命的基础 。 早期的柱式合成不但成本高 , 通量也比较低 , 尚不能支撑合成生物产业的快速发展 。 但之后的芯片合成技术和超高通量芯片合成技术 , 已经能够实现在节省试剂的同时 , 进行大规模高通量合成 , 显著提升基因合成效率 , 且成本仅有旧式柱式合成技术的万分之一到百分之一 , 只是仍有合成工艺要求严格 , 会产生污染性有机化学废弃物等缺陷[6] 。 而最新一代的酶促合成技术则兼具作用条件温和 , 合成准确性高 , 副产物少等优点 , 颇具潜力但相比较之下仍处早期阶段 , 不够成熟 。
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高通量:指一次可检测多个样本或对同一样本进行多种检测的技术 。
引物:是指在核苷酸聚合作用起始时 , 一种具有特定核苷酸序列并能刺激合成的大分子 , 与反应物以氢键形式连接 , 这样的分子称为引物 。 体外人工设计的引物被广泛用于聚合酶链反应、测序和探针合成等 。
下游
由于合成生物学覆盖行业广泛 , 产业链公司也表现出了高度多样化的特征 , 总体可分为平台型与产品型两大类 。 平台型公司更注重对菌株的改造 , 致力于模块化与通用化;产品型公司则主要关注发酵以及后续环节 , 旨在实现规模化生产 , 以及解决后续的销售渠道 , 确立商业模式等更具体的落地问题 。
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