细胞|基因编辑工具箱多了把“瑞士军刀”

据近日发表在《分子细胞》杂志上的一项研究 , 一种名为CasMINI的紧凑高效的CRISPR-Cas系统可广泛用于细胞工程和基因治疗 , 因为它更容易进入细胞 。
美国斯坦福大学生物工程助理教授齐磊表示 , 这是CRISPR基因组工程应用向前迈出的关键一步 。 “据我们所知 , 作为一种基因组编辑技术 , 这是迄今为止最小的CRISPR 。 如果将Cas9视为分子剪刀 , 那么我们创造的就是一把包含多种功能的瑞士军刀 。 ”
CRISPR-Cas系统为开发各种遗传疾病的基因疗法提供了机会 , 但它们尺寸太大 , 递送到细胞、组织或生物体中会受限制 , 从而阻碍临床应用 , 因此需要设计更加高效、紧凑的Cas系统 。
一种可能的解决方案是Cas12f 。 该蛋白介于400—700个氨基酸之间 , 大小还不到目前使用的CRISPR系统(如Cas9或Cas12a)的一半 。 “近年来已经鉴定出数千个CRISPR 。 ”齐磊解释说 , “然而 , 超过99.9%的已发现CRISPR无法在人类细胞中发挥作用 , 这限制了它们作为基因组编辑技术的使用 。 ”
在这项新研究中 , 齐磊及其团队将RNA和蛋白工程应用于Cas12f系统 , 以生成用于哺乳动物基因组工程的高效微型Cas系统 。 Cas12f天然起源于古细菌(单细胞生物) , 这意味着它不太适合哺乳动物细胞 , 更不用说人类细胞或身体 。 但通过优化单向导RNA设计并进行多轮迭代蛋白工程和筛选 , 研究人员最终生成了一类名为CasMINI的Cas12f变体 。
工程化的Cas12f蛋白变体与工程化的单向导RNA相结合 , 表现出有效的基因调控和基因编辑活性 。 CasMINI可以驱动与Cas12a相关的高水平基因活性 , 并允许进行稳健的碱基编辑和基因编辑 。 此外 , 它具有高度特异性 , 不会产生可检测的脱靶效应 。
工程化CasMINI分子的大小仅为529个氨基酸 。 这种小尺寸使其适用于广泛的治疗 。 此外 , CasMINI mRNA可以很容易地包装到脂质纳米颗粒或其他RNA递送方式中 , 潜在地增强了其进入细胞的能力 。
“微型CasMINI的可及性实现了新的应用 , 从体外应用(例如设计更好的肿瘤杀伤淋巴细胞或重编程干细胞)到体内基因疗法(治疗眼睛、肌肉或肝脏的遗传疾病) 。 ”齐磊说 , “它将成为治疗遗传疾病、治愈癌症和逆转器官退化的方法 。 ”
【细胞|基因编辑工具箱多了把“瑞士军刀”】总编辑圈点
与前几代基因编辑工具 , 如锌指酶相比 , CRISPR系统已经凭借其成本低廉、简便易用 , 风靡全球众多生物医学实验室 , 成为该领域无数科研人员手中的高效工具 。 尽管如此 , CRISPR系统还难称完美 , 所以它依然在不断升级和完善之中 。 仅在近期 , 就有多个捷报传来:例如开发出迄今为止最小的CRISPR、围绕CRISPR系统开发RNA递送平台等等 。 这些研究进展都会使CRISPR这把“基因剪刀”越来越强大 。 采访人员张梦然