唯一的区别就是毕业时拿到的证不同，双证工程硕士会拿到工程硕士学位，工学硕士会拿到工学硕士学位，两者在效力上是等价的 。两者都会拿到所在学校颁发的毕业证 。与双证工程硕士相区别的是单证工程硕士，单证的毕业的时候只能拿到学位证而不能拿到毕业证

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工程硕士和专业硕士的区别，工程硕士与专业硕士的区别？
【什么是工程硕士,工程硕士和专业硕士的区别，工程硕士与专业硕士的区别？】工程硕士(工硕)属于专业硕士(专硕) 里的一类，专硕的外延更广泛 。专硕 相对于学硕 (学术型硕士)而言，更强调专业实际能力，但就我国研究生教育现实情况，专硕的入学考试难度 明显低于学硕 。专硕包括工程硕士、法律硕士、工商管理硕士(MBA)，公共管理硕士(MPA)等等 。

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