凌恩生物报告升级，科研美图助力群落互作机制研究 2022年

2022年，在多位技术支持与生信工程师的通力合作下凌恩生物报告升级重磅升级！扩增子分析流程项目从60+到120+ ，可谓是加量不加价的超值更新了！结题报告的结果图片可直接用于文章发表，快一起来看看！小小的举个例子：中国水产科学院近期在《InternationalJournalofMolecularSciences》期刊上(IF=6.208)发表的“ApexPredatorsEnhanceEnvironmentalAdaptationbutReduceCommunityStabilityofBacterioplanktoninCrustaceanAquaculturePonds”研究论文中，通过16SV4-V5区扩增子测序，揭示了顶端捕食者干扰水产养殖系统中浮游细菌群落的反应机制，各位老师请注意关注文章图片哦。

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期刊：InternationalJournalofMolecularSciences
影响因子：6.208
【凌恩生物报告升级，科研美图助力群落互作机制研究】发表时间：2022
样本类型：水样
客户单位：中国水产科学院
一、研究背景
全球人口的不断增长增加了对粮食的需求，水产品是近年来不断扩大的基本食物来源。水产养殖环境蕴藏着复杂的细菌群落，对养殖物种的生长和健康至关重要。顶端捕食者占据食物网顶部的位置，并在生态系统稳定性方面发挥关键作用，因此顶端捕食者经常被加入到水产养殖池塘中。然而，探索顶端捕食者对浮游细菌群落组成和功能的影响，以及群落聚集的潜在机制的研究非常有限。研究旨在调查受顶端捕食者物种影响的水产养殖系统中浮游细菌群落的聚集动力学，以及破译顶端捕食者干扰引起的浮游细菌种群变化的机制。
二、实验设计
本研究对8个包括中华绒螯蟹（Eriocheirsinensis）和日本沼虾（Macrobrachiumniponensis）的养殖池塘进行了研究。其中4个池塘包含作为顶端捕食者的鳜鱼（Sinipercachuatsi）（PC组），另外4个池塘没有顶端捕食者（MC组）。在水产养殖过程中，在四个阶段从每个池塘采集五个水样并混合，每个样本2L水样滤膜收集细菌细胞，从剩余水样中测定环境因素。随后开展DNA提取和16SrRNAV4-V5区域测序并进行数据分析。
三、实验结果
1、浮游细菌α多样性
计算了四个α多样性指数来评估浮游细菌群落。在不同培养阶段的浮游细菌种群之间，或在MC和PC池塘之间，没有观察到任何α多样性指标的显著差异。结果表明，浮游细菌群落的多样性在养殖过程中趋于稳定，顶端捕食者干扰对其没有明显影响。
2、有无顶端捕食者干扰的不同培养阶段浮游细菌群落的变化
Bray–Curtis距离的PCoA表明不同培养阶段的浮游细菌群落分别聚集在一起（图1a），捕食者顶端干扰及其相互作用均显著影响浮游细菌群落。门水平的细菌的相对丰度如图1b所示。变形菌门是最主要的门，其次是拟杆菌门、厚壁菌门和放线菌门，随着培养的进行，不同门的细菌有着不同的变化。结果表明，顶端捕食者的干扰并没有显著改变养殖过程中的浮游细菌组成，但它确实影响了细菌丰度的变化幅度。
使用随机森林模型，确定细菌群落的组成与培养阶段和顶端捕食者干扰密切相关（图1c）。将浮游细菌群落总体变化的结果与随机森林模型分析的结果相结合，表明顶端捕食者显著改变了低丰度物种的丰度，但它们并没有显著改变总体群落组成。

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图1浮游细菌群落随培养阶段和捕食者分布顶点的变化
3、浮游细菌群落的环境适应
测量了八个环境因素，以评估培养阶段和顶端捕食者的影响。 MC和PC池塘中浮游细菌群落的65.89%的变异可由选定的环境因素解释（图2a）。除溶解氧、亚硝酸盐和总磷外，大多数环境因素与浮游细菌群落之间存在显著相关性。不同培养阶段的浮游细菌群落被环境因素明显区分。从第一阶段开始，水温与浮游细菌群落呈正相关，而氨和pH值与菌群成负相关。此外，硝酸盐和TN浓度分别与第二阶段和第三阶段至第四阶段的浮游细菌群落呈负相关。