病原体|宁夏：快速鉴别病原型别新冠突变病毒株

采访人员近日从宁夏科技厅获悉，该厅支持自治区疾病预防控制中心牵头实施的“基于新型冠状病毒感染的病毒性肺炎防控机制和关键技术的应用研究”项目，构建了呼吸道病原体多病原快速鉴定平台，已具备4小时内快速鉴定和初步锁定病原型别的新冠突变病毒株（VOC）的能力。
“快速检测能力是疫情防控的基础保障， 2020年初，突如其来的新冠肺炎疫情暴露出我区传染病预防控制检测技术的诸多不足，我们旋即启动‘绿色通道’ ，支持自治区疾控中心牵头展开相关研究。 ”宁夏科技厅社会发展科技处处长张磊告诉采访人员。
【病原体|宁夏：快速鉴别病原型别新冠突变病毒株】该项目建立了基于宁夏新冠肺炎的突发传染病预警预测模型、病原体溯源高通量测序技术平台、新冠病毒核酸检测质量控制体系，并培养出一支全基因测序和传染病疫情趋势预测技术队伍。今年以来，项目组利用搭建的宁夏深度基因测序平台和快速鉴定技术，挖掘病毒基因信息、追溯疫情来源，为全区新冠疫情防控贡献了重要技术支撑。
7月30日，项目组对宁夏确诊外省输入新冠肺炎病例张某某进行病毒溯源分析，确定该标本为德尔塔变异株。 8月底，对南非回国的两例新冠阳性患者测序溯源，发现病毒来源于南非，而非德尔塔变异株。在近期的“10月西北旅行团”疫情中，首例病例确诊后36小时即获得深度测序结果，与陕、甘、内蒙古提供的基因序列比对发现高度同源，从而锁定传播链条，并据此制定出精准防控措施。
据悉，项目组目前已测序获得36株新冠病毒全基因组序列，均属同一传播链。同时，采用掌握的SIR模型对“10·17”银川疫情传播链发病趋势进行了预测，为疫情科学防控提供了有效建议。
在此基础上，项目组还将新冠病毒核酸检测质控体系应用于全区新冠病毒核酸检测实验室验收评估和质控中，有力提升了宁夏新冠病毒核酸检测水平。采访人员王迎霞通讯员陈慧