基于量子化学计算和机器学习,从头开始创建肉眼可检测的荧光分子( 二 )


基于量子化学计算和机器学习,从头开始创建肉眼可检测的荧光分子
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图示:在B3LYP/3-21G*水平上 , 生成分子的S1状态吸收和荧光的OS分布曲线 。 (来源:论文)
虽然相对简单的特性 , 如光吸收和电子增益能量 , 可以直接与分子结构相关 , 但复杂的现象 , 如仅由特定分子表现出的荧光 , 难度要大得多 。
在荧光的情况下 , 有必要考虑多种性质 , 这些性质错综复杂地交织在一起 。 这使得很难为分子结构的设计建立直观的指导方针 。 为了设计实用的化合物 , 控制目标分子特性的复杂机制必须适当地数字化以用于DNMG 。 此外 , 必须考虑计算成本随着探索化学空间的机制复杂性的增加而增加 。
基于量子化学计算和机器学习,从头开始创建肉眼可检测的荧光分子
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图示:使用ChemTS设计的未报告的荧光分子 。 (来源:论文)
在这项研究中 , 该团队设计了具有大规模并行化ChemTS版本的荧光分子 。 该程序包使用QC将荧光机制的最低要求数字化 。 有几个基于电子结构理论的用户友好软件包可用于分子和材料的QC 。
为了平衡可靠性与计算成本 , 研究人员使用密度泛函理论(DFT)(29)来评估势能面(PES) 。 为了解决广泛探索化学空间的计算成本 , 用基于虚拟损失的概念对ChemTS进行大规模并行化;使用1024个核 , 生成了3643个分子 。
为了验证 , 他们合成了一种未报告的化合物和几种已报告的化合物 。 六种化合物 , 包括一种未报道的化合物 , 如预期的那样发出荧光 。 未报道的分子可通过市售试剂之间的偶联合成 , 具有意想不到的特性 , 尽管它由常见的片段[香豆素、吡啶和吡唑并嘧啶]组成 。 这表明大规模并行DNMG有可能引发分子设计的范式转变 。
基于量子化学计算和机器学习,从头开始创建肉眼可检测的荧光分子
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图示:PC的光致过程 。 (来源:论文)
讨论
几十年来 , QC在化学和材料科学中发挥了重要作用 。 在此期间 , 计算机辅助分子设计已被用于药物发现 。 然而 , QC只专注于对实验结果的分析和推测;很少考虑诸如预测各种现象和设计材料之类的创造性工作 。
ML算法最近在化学和材料科学中的应用 , 代表了计算机辅助化学和材料科学的一个积极转折点 。 为了自动设计对有机电子有用的分子 , 将QC与DNMG相结合至关重要 , 因为在此类应用中 , 量子力学不容忽视 。 然而 , 基于QC的DNMG的价值必须先得到证明 , 然后才能在实践中采用 。
在这项研究中 , 研究人员使用DNMG来创建具有目前无法轻易预测的特性的分子:荧光 。 他们使用DFT设计了荧光化合物 , 这是一种固有的量子力学方法 。 尽管众所周知 , 分子受量子力学规则的支配 , 但仅凭QC很难从头创建一个新分子 。 尽管荧光分子具有简单的PES , 但它们很难从第一原理设计 , 因为它们的多样性使得荧光与分子结构的关联变得非常困难 。
基于量子化学计算和机器学习,从头开始创建肉眼可检测的荧光分子
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图示:PC的光化学性质 。 (来源:论文)
然而 , 生成器处理了这种多样性 , 并成功地从头开始设计了荧光分子 。 基于QC的大量从头计算需要大量并行计算(1024核 , 5天);尽管如此 , 生成器还是成功地产生了3643个候选分子 。 发生器产生吸收长波长光的分子 , 以类似于专业人士的方式控制分子的共轭长度;然而 , 它无法找到分子的荧光波长/强度与共轭长度/芳环数之间的明确相关性 。 这表明从头设计荧光分子的困难 。
研究人员根据可合成性和可见荧光标准 , 选择了七种已知化合物进行验证和一种候选化合物进行进一步研究 。 实验验证表明 , DNMG成功设计了75%(八分之六)的荧光化合物 。 PC的荧光(肉眼可见)证明了DNMG的创新潜力 。